Protege aproximadamente el 70% de la flora del bosque templado sudamericano, con 254 plantas nativas (58 endémicas), 25 de ellas amenazadas como el mañío de hojas largas. Su selva valdiviana alberga desde bosques siempreverdes hasta vegetación achaparrada de altura con lenga, ñirre y canelo. Su fauna incluye puma, pudú (vulnerable), huiña, monito del monte (marsupial más antiguo) y la ranita de Darwin. Los hongos (changle, loyo, gargal) cumplen un rol ecológico esencial como descomponedores, reciclando nutrientes en el suelo
